Yksi tavallisista vasta-argumentteja hilihydraattien rajoittamiselle on proteiinin mahdolliset munuaishaitat. VHH sisältää usein joko runsaasti proteiinia ja/tai tyydyttynyttä rasvaa, jotka molemmat saattavat vaikuttaa munuaisiin. VHH:n vaikutuksia munuaistoimintaan on tutkittu melko vähän ja tutkimukset rajoittuvat henkilöihin, joilla on lähtökohtaisesti terveet munuaiset. Tämä on vähähiilihydraattista ruokavaliota koskettavan kirjoitussarjan viides osa.