Fruktoosin aiheuttamat metaboliset haitat ovat vain osittain sille ominaisia, suurelta osin ne ovat kuitenkin ominaisia kaikille raffinoiduille hiilihydraateille. Liiallisesti sokerina tai fruktoosisiirappina käytettynä fruktoosi aiheuttaa paitsi lihomista myös rasva-aineenvaihdunnan häiriöitä ja maksan rasvoittumista sekä suolisto-oireita. Hedelmistä ja marjoista saatavaa fruktoosia ei ole yhdistetty terveyshaittoihin.