Aikuisten toiminnallisten vatsavaivojen, erityisesti ärtyvän suolen oireyhtymän hoitoon kuuluu probiootin kokeilu. Se auttaa meta-analyysin mukaan ainakin turvotustyyppisiin oireisiin. Tuoreessa toistaiseksi suurimmassa lasten toiminnallisia vatsavaivoja koskevassa probioottitutkimuksessa havaittiin, että toiminnallisesta vatsakivusta kärsivillä lapsilla Lactobacillus rhamnosus GG vähentää kipua enemmän kuin lume. Lisäksi LGG vaikutti myönteisesti suoliston läpäisevyyteen.